Flash Playerのプラグインが二重にインストールされている可能性があり、以下の方法で治るかもしれません。

アドレスバーに以下を入力。

chrome://plugins/

プラグイン一覧が表示されたらAdobe Flash Playerを探し画面右上の[＋] 詳細をクリック。
私の場合は以下のように表示されました。

Adobe Flash Player (2 files) – バージョン: 12.0.0.70Shockwave Flash 12.0 r0

名前: Shockwave Flash
説明: Shockwave Flash 12.0 r0
バージョン: 12.0.0.70
場所: C:\Program Files\Google\Chrome\Application\33.0.1750.117\PepperFlash\pepflashplayer.dll
タイプ: PPAPI（プロセス外）
無効にする

名前: Shockwave Flash
説明: Shockwave Flash 12.0 r0
バージョン: 12,0,0,70
場所: C:\Windows\system32\Macromed\Flash\NPSWF32_12_0_0_70.dll
タイプ: NPAPI
無効にする

このPPAPI（プロセス外）のほうを無効にすると治りました。こっちが新しいハズなのに…

以下のサイトの情報を参考にさせていただきました。ありがとうございました！

http://net-business-concieruge.doorblog.jp/archives/3652808.html